Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK06

Fbxo9, F-box only protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo9Q8BK06 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo9Q8BK06 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo9Q8BK06 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo9Q8BK06 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo9Q8BK06 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo9Q8BK06 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo9Q8BK06 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo9Q8BK06 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo9Q8BK06 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo9Q8BK06 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo9Q8BK06 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo9Q8BK06 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo9Q8BK06 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo9Q8BK06 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo9Q8BK06 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo9Q8BK06 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo9Q8BK06 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo9Q8BK06 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fbxo9Q8BK06 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fbxo9Q8BK06 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fbxo9Q8BK06 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fbxo9Q8BK06 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fbxo9Q8BK06 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fbxo9Q8BK06 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms