Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD7

Npas4, Neuronal PAS domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas4Q8BGD7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Npas4Q8BGD7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Npas4Q8BGD7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npas4Q8BGD7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2277.6 ms