Protein–RNA interactions for Protein: Q80U62

Rubcn, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnQ80U62 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RubcnQ80U62 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RubcnQ80U62 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RubcnQ80U62 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms