Protein–RNA interactions for Protein: Q80SY5

Prpf38b, Pre-mRNA-splicing factor 38B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38bQ80SY5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf38bQ80SY5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf38bQ80SY5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf38bQ80SY5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf38bQ80SY5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf38bQ80SY5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf38bQ80SY5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf38bQ80SY5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf38bQ80SY5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf38bQ80SY5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf38bQ80SY5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf38bQ80SY5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf38bQ80SY5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf38bQ80SY5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf38bQ80SY5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf38bQ80SY5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf38bQ80SY5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf38bQ80SY5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf38bQ80SY5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf38bQ80SY5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf38bQ80SY5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms