Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clec18aQ7TSQ1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clec18aQ7TSQ1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Clec18aQ7TSQ1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Clec18aQ7TSQ1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clec18aQ7TSQ1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clec18aQ7TSQ1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clec18aQ7TSQ1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clec18aQ7TSQ1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clec18aQ7TSQ1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clec18aQ7TSQ1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clec18aQ7TSQ1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clec18aQ7TSQ1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Clec18aQ7TSQ1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clec18aQ7TSQ1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clec18aQ7TSQ1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clec18aQ7TSQ1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clec18aQ7TSQ1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clec18aQ7TSQ1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clec18aQ7TSQ1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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