Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mycbp2Q7TPH6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mycbp2Q7TPH6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mycbp2Q7TPH6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mycbp2Q7TPH6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mycbp2Q7TPH6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mycbp2Q7TPH6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mycbp2Q7TPH6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mycbp2Q7TPH6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mycbp2Q7TPH6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Mycbp2Q7TPH6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 347.3 ms