Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TwistnbQ78WZ7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TwistnbQ78WZ7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TwistnbQ78WZ7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms