Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp8b3Q6UQ17 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp8b3Q6UQ17 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp8b3Q6UQ17 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp8b3Q6UQ17 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp8b3Q6UQ17 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp8b3Q6UQ17 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp8b3Q6UQ17 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp8b3Q6UQ17 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp8b3Q6UQ17 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp8b3Q6UQ17 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp8b3Q6UQ17 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp8b3Q6UQ17 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp8b3Q6UQ17 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp8b3Q6UQ17 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp8b3Q6UQ17 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp8b3Q6UQ17 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp8b3Q6UQ17 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp8b3Q6UQ17 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp8b3Q6UQ17 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp8b3Q6UQ17 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp8b3Q6UQ17 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp8b3Q6UQ17 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp8b3Q6UQ17 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp8b3Q6UQ17 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp8b3Q6UQ17 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp8b3Q6UQ17 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp8b3Q6UQ17 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms