Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc82Q6PG04 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc82Q6PG04 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.3 ms