Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mfsd13aQ6PDE8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.6 ms