Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhb9Q6PB60 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms