Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrig3Q6P1C6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrig3Q6P1C6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrig3Q6P1C6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrig3Q6P1C6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrig3Q6P1C6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrig3Q6P1C6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrig3Q6P1C6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrig3Q6P1C6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrig3Q6P1C6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrig3Q6P1C6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrig3Q6P1C6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrig3Q6P1C6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrig3Q6P1C6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrig3Q6P1C6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrig3Q6P1C6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrig3Q6P1C6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrig3Q6P1C6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrig3Q6P1C6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrig3Q6P1C6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrig3Q6P1C6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrig3Q6P1C6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms