Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Colgalt2Q6NVG7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms