Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retreg2Q6NS82 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retreg2Q6NS82 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms