Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8S8

B4galnt3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4galnt3Q6L8S8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
B4galnt3Q6L8S8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
B4galnt3Q6L8S8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
B4galnt3Q6L8S8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
B4galnt3Q6L8S8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
B4galnt3Q6L8S8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
B4galnt3Q6L8S8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
B4galnt3Q6L8S8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
B4galnt3Q6L8S8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
B4galnt3Q6L8S8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
B4galnt3Q6L8S8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
B4galnt3Q6L8S8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms