Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV1

Fam196b, Protein FAM196B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam196bQ6GQV1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam196bQ6GQV1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam196bQ6GQV1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam196bQ6GQV1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam196bQ6GQV1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam196bQ6GQV1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam196bQ6GQV1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Fam196bQ6GQV1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam196bQ6GQV1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam196bQ6GQV1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam196bQ6GQV1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam196bQ6GQV1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam196bQ6GQV1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam196bQ6GQV1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam196bQ6GQV1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam196bQ6GQV1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam196bQ6GQV1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam196bQ6GQV1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam196bQ6GQV1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam196bQ6GQV1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam196bQ6GQV1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam196bQ6GQV1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam196bQ6GQV1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam196bQ6GQV1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fam196bQ6GQV1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam196bQ6GQV1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam196bQ6GQV1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam196bQ6GQV1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam196bQ6GQV1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam196bQ6GQV1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam196bQ6GQV1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam196bQ6GQV1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam196bQ6GQV1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam196bQ6GQV1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam196bQ6GQV1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam196bQ6GQV1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam196bQ6GQV1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam196bQ6GQV1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam196bQ6GQV1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam196bQ6GQV1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam196bQ6GQV1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam196bQ6GQV1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam196bQ6GQV1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam196bQ6GQV1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam196bQ6GQV1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam196bQ6GQV1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam196bQ6GQV1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam196bQ6GQV1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam196bQ6GQV1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam196bQ6GQV1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam196bQ6GQV1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam196bQ6GQV1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam196bQ6GQV1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam196bQ6GQV1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam196bQ6GQV1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam196bQ6GQV1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam196bQ6GQV1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam196bQ6GQV1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam196bQ6GQV1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam196bQ6GQV1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam196bQ6GQV1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam196bQ6GQV1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam196bQ6GQV1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam196bQ6GQV1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam196bQ6GQV1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam196bQ6GQV1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms