Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Top2bQ64511 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Top2bQ64511 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Top2bQ64511 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Top2bQ64511 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Top2bQ64511 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Top2bQ64511 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Top2bQ64511 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Top2bQ64511 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Top2bQ64511 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Top2bQ64511 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Top2bQ64511 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Top2bQ64511 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Top2bQ64511 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Top2bQ64511 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Top2bQ64511 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Top2bQ64511 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Top2bQ64511 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Top2bQ64511 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Top2bQ64511 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Top2bQ64511 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Top2bQ64511 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Top2bQ64511 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
Top2bQ64511 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Top2bQ64511 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Top2bQ64511 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Top2bQ64511 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Top2bQ64511 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Top2bQ64511 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Top2bQ64511 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Top2bQ64511 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Top2bQ64511 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Top2bQ64511 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Top2bQ64511 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Top2bQ64511 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Top2bQ64511 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Top2bQ64511 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Top2bQ64511 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Top2bQ64511 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Top2bQ64511 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Top2bQ64511 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Top2bQ64511 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Top2bQ64511 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC36.45■■■■□ 3.42
Top2bQ64511 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Top2bQ64511 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Top2bQ64511 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Top2bQ64511 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Top2bQ64511 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Top2bQ64511 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Top2bQ64511 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Top2bQ64511 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Top2bQ64511 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Top2bQ64511 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Top2bQ64511 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Top2bQ64511 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Top2bQ64511 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Top2bQ64511 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Top2bQ64511 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Top2bQ64511 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Top2bQ64511 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Top2bQ64511 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Top2bQ64511 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Top2bQ64511 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Top2bQ64511 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Top2bQ64511 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Top2bQ64511 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Top2bQ64511 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Top2bQ64511 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Top2bQ64511 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Top2bQ64511 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Top2bQ64511 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Top2bQ64511 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Top2bQ64511 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Top2bQ64511 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Top2bQ64511 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Top2bQ64511 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Top2bQ64511 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Top2bQ64511 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Top2bQ64511 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Top2bQ64511 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Top2bQ64511 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Top2bQ64511 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Top2bQ64511 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Top2bQ64511 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Top2bQ64511 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Top2bQ64511 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Top2bQ64511 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Top2bQ64511 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Top2bQ64511 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Top2bQ64511 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Top2bQ64511 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Top2bQ64511 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Top2bQ64511 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Top2bQ64511 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Top2bQ64511 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Top2bQ64511 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Top2bQ64511 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Top2bQ64511 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Top2bQ64511 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Top2bQ64511 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms