Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim24Q64127 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim24Q64127 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim24Q64127 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms