Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim25Q61510 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim25Q61510 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim25Q61510 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim25Q61510 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim25Q61510 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim25Q61510 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms