Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ecm1Q61508 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ecm1Q61508 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ecm1Q61508 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ecm1Q61508 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm1Q61508 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm1Q61508 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ecm1Q61508 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ecm1Q61508 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ecm1Q61508 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ecm1Q61508 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ecm1Q61508 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ecm1Q61508 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ecm1Q61508 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ecm1Q61508 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ecm1Q61508 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ecm1Q61508 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ecm1Q61508 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ecm1Q61508 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ecm1Q61508 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ecm1Q61508 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm1Q61508 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm1Q61508 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm1Q61508 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm1Q61508 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm1Q61508 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ecm1Q61508 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ecm1Q61508 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms