Protein–RNA interactions for Protein: Q61315

Apc, Adenomatous polyposis coli protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcQ61315 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApcQ61315 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApcQ61315 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApcQ61315 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApcQ61315 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApcQ61315 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApcQ61315 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ApcQ61315 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApcQ61315 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApcQ61315 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApcQ61315 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApcQ61315 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApcQ61315 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApcQ61315 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApcQ61315 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApcQ61315 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApcQ61315 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApcQ61315 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms