Protein–RNA interactions for Protein: Q61180

Scnn1a, Amiloride-sensitive sodium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1aQ61180 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scnn1aQ61180 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scnn1aQ61180 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Scnn1aQ61180 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scnn1aQ61180 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scnn1aQ61180 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scnn1aQ61180 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Scnn1aQ61180 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scnn1aQ61180 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scnn1aQ61180 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scnn1aQ61180 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scnn1aQ61180 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scnn1aQ61180 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Scnn1aQ61180 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scnn1aQ61180 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scnn1aQ61180 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scnn1aQ61180 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scnn1aQ61180 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scnn1aQ61180 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Scnn1aQ61180 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scnn1aQ61180 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scnn1aQ61180 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scnn1aQ61180 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Scnn1aQ61180 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Scnn1aQ61180 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Scnn1aQ61180 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Scnn1aQ61180 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scnn1aQ61180 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scnn1aQ61180 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms