Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp4Q61107 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp4Q61107 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms