Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csnk2a1Q60737 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms