Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HnrnpdQ60668 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HnrnpdQ60668 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HnrnpdQ60668 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms