Protein–RNA interactions for Protein: Q5UAK0

Mier1, Mesoderm induction early response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier1Q5UAK0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Mier1Q5UAK0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Mier1Q5UAK0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Mier1Q5UAK0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Mier1Q5UAK0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Mier1Q5UAK0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Mier1Q5UAK0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Mier1Q5UAK0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Mier1Q5UAK0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Mier1Q5UAK0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Mier1Q5UAK0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Mier1Q5UAK0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Mier1Q5UAK0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Mier1Q5UAK0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Mier1Q5UAK0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Mier1Q5UAK0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Mier1Q5UAK0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Mier1Q5UAK0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Mier1Q5UAK0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Mier1Q5UAK0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Mier1Q5UAK0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Mier1Q5UAK0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Mier1Q5UAK0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Mier1Q5UAK0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Mier1Q5UAK0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Mier1Q5UAK0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Mier1Q5UAK0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Mier1Q5UAK0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Mier1Q5UAK0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Mier1Q5UAK0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Mier1Q5UAK0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Mier1Q5UAK0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Mier1Q5UAK0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Mier1Q5UAK0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Mier1Q5UAK0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Mier1Q5UAK0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Mier1Q5UAK0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Mier1Q5UAK0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Mier1Q5UAK0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms