Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE3

Ccdc92b, Coiled-coil domain-containing 92B, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92bQ5SUE3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc92bQ5SUE3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc92bQ5SUE3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc92bQ5SUE3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc92bQ5SUE3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.4 ms