Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rtp3Q5QGU6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rtp3Q5QGU6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rtp3Q5QGU6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rtp3Q5QGU6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rtp3Q5QGU6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rtp3Q5QGU6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rtp3Q5QGU6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rtp3Q5QGU6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rtp3Q5QGU6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtp3Q5QGU6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms