Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scarf1Q5ND28 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Scarf1Q5ND28 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.6 ms