Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCI0

Urgcp, Up-regulator of cell proliferation, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UrgcpQ5NCI0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UrgcpQ5NCI0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UrgcpQ5NCI0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UrgcpQ5NCI0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UrgcpQ5NCI0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UrgcpQ5NCI0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UrgcpQ5NCI0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UrgcpQ5NCI0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UrgcpQ5NCI0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UrgcpQ5NCI0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UrgcpQ5NCI0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UrgcpQ5NCI0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UrgcpQ5NCI0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UrgcpQ5NCI0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms