Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WhammQ571B6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
WhammQ571B6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
WhammQ571B6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms