Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spire1Q52KF3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spire1Q52KF3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spire1Q52KF3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spire1Q52KF3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spire1Q52KF3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spire1Q52KF3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spire1Q52KF3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spire1Q52KF3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spire1Q52KF3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spire1Q52KF3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spire1Q52KF3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spire1Q52KF3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spire1Q52KF3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spire1Q52KF3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spire1Q52KF3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spire1Q52KF3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spire1Q52KF3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Spire1Q52KF3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spire1Q52KF3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Spire1Q52KF3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spire1Q52KF3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spire1Q52KF3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spire1Q52KF3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spire1Q52KF3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spire1Q52KF3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Spire1Q52KF3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spire1Q52KF3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms