Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2cd3Q52KB6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2cd3Q52KB6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2cd3Q52KB6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2cd3Q52KB6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2cd3Q52KB6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2cd3Q52KB6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2cd3Q52KB6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2cd3Q52KB6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2cd3Q52KB6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2cd3Q52KB6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C2cd3Q52KB6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2cd3Q52KB6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.4 ms