Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prpf38aQ4FK66 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Prpf38aQ4FK66 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prpf38aQ4FK66 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms