Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc27Q3V036 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc27Q3V036 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms