Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD7

Fam71f1, Protein FAM71F1, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71f1Q3UZD7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam71f1Q3UZD7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam71f1Q3UZD7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam71f1Q3UZD7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam71f1Q3UZD7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam71f1Q3UZD7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam71f1Q3UZD7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam71f1Q3UZD7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam71f1Q3UZD7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam71f1Q3UZD7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam71f1Q3UZD7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam71f1Q3UZD7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam71f1Q3UZD7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam71f1Q3UZD7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam71f1Q3UZD7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam71f1Q3UZD7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam71f1Q3UZD7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam71f1Q3UZD7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam71f1Q3UZD7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam71f1Q3UZD7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam71f1Q3UZD7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam71f1Q3UZD7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam71f1Q3UZD7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam71f1Q3UZD7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam71f1Q3UZD7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam71f1Q3UZD7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam71f1Q3UZD7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam71f1Q3UZD7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms