Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnaaf3Q3UYV8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnaaf3Q3UYV8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnaaf3Q3UYV8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnaaf3Q3UYV8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnaaf3Q3UYV8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnaaf3Q3UYV8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnaaf3Q3UYV8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnaaf3Q3UYV8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnaaf3Q3UYV8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnaaf3Q3UYV8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnaaf3Q3UYV8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnaaf3Q3UYV8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnaaf3Q3UYV8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnaaf3Q3UYV8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnaaf3Q3UYV8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnaaf3Q3UYV8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnaaf3Q3UYV8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnaaf3Q3UYV8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnaaf3Q3UYV8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnaaf3Q3UYV8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dnaaf3Q3UYV8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dnaaf3Q3UYV8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dnaaf3Q3UYV8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dnaaf3Q3UYV8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dnaaf3Q3UYV8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dnaaf3Q3UYV8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dnaaf3Q3UYV8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dnaaf3Q3UYV8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dnaaf3Q3UYV8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dnaaf3Q3UYV8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dnaaf3Q3UYV8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dnaaf3Q3UYV8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dnaaf3Q3UYV8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dnaaf3Q3UYV8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dnaaf3Q3UYV8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dnaaf3Q3UYV8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dnaaf3Q3UYV8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dnaaf3Q3UYV8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dnaaf3Q3UYV8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dnaaf3Q3UYV8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dnaaf3Q3UYV8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dnaaf3Q3UYV8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dnaaf3Q3UYV8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dnaaf3Q3UYV8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dnaaf3Q3UYV8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dnaaf3Q3UYV8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dnaaf3Q3UYV8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms