Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clpsl2Q3UW21 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Clpsl2Q3UW21 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Clpsl2Q3UW21 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clpsl2Q3UW21 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clpsl2Q3UW21 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Clpsl2Q3UW21 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clpsl2Q3UW21 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clpsl2Q3UW21 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms