Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTC0

B020004J07Rik, RIKEN cDNA B020004J07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020004J07RikQ3UTC0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
B020004J07RikQ3UTC0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B020004J07RikQ3UTC0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B020004J07RikQ3UTC0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B020004J07RikQ3UTC0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
B020004J07RikQ3UTC0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B020004J07RikQ3UTC0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B020004J07RikQ3UTC0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
B020004J07RikQ3UTC0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms