Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR97

Snx21, Sorting nexin-21, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx21Q3UR97 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx21Q3UR97 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx21Q3UR97 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx21Q3UR97 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx21Q3UR97 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx21Q3UR97 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx21Q3UR97 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx21Q3UR97 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx21Q3UR97 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx21Q3UR97 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx21Q3UR97 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx21Q3UR97 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx21Q3UR97 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snx21Q3UR97 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx21Q3UR97 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx21Q3UR97 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx21Q3UR97 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx21Q3UR97 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx21Q3UR97 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx21Q3UR97 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx21Q3UR97 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx21Q3UR97 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx21Q3UR97 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx21Q3UR97 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx21Q3UR97 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx21Q3UR97 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms