Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec31aQ3UPL0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sec31aQ3UPL0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec31aQ3UPL0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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