Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nlrc4Q3UP24 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrc4Q3UP24 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms