Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc33Q3ULW6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc33Q3ULW6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc33Q3ULW6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms