Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI43

Babam1, BRISC and BRCA1-A complex member 1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Babam1Q3UI43 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Babam1Q3UI43 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Babam1Q3UI43 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Babam1Q3UI43 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Babam1Q3UI43 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Babam1Q3UI43 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Babam1Q3UI43 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Babam1Q3UI43 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Babam1Q3UI43 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Babam1Q3UI43 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Babam1Q3UI43 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Babam1Q3UI43 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Babam1Q3UI43 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Babam1Q3UI43 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms