Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tnrc6cQ3UHC0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnrc6cQ3UHC0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnrc6cQ3UHC0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnrc6cQ3UHC0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnrc6cQ3UHC0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnrc6cQ3UHC0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tnrc6cQ3UHC0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tnrc6cQ3UHC0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tnrc6cQ3UHC0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tnrc6cQ3UHC0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tnrc6cQ3UHC0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tnrc6cQ3UHC0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tnrc6cQ3UHC0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tnrc6cQ3UHC0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Tnrc6cQ3UHC0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.9 ms