Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGR5

Hdhd2, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd2Q3UGR5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdhd2Q3UGR5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdhd2Q3UGR5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdhd2Q3UGR5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdhd2Q3UGR5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdhd2Q3UGR5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdhd2Q3UGR5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdhd2Q3UGR5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdhd2Q3UGR5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdhd2Q3UGR5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdhd2Q3UGR5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdhd2Q3UGR5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdhd2Q3UGR5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdhd2Q3UGR5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdhd2Q3UGR5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdhd2Q3UGR5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdhd2Q3UGR5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdhd2Q3UGR5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdhd2Q3UGR5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdhd2Q3UGR5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdhd2Q3UGR5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdhd2Q3UGR5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdhd2Q3UGR5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdhd2Q3UGR5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hdhd2Q3UGR5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms