Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEI1

Pde4c, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, mousemouse

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Length 686 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4cQ3UEI1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Pde4cQ3UEI1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Pde4cQ3UEI1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Pde4cQ3UEI1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Pde4cQ3UEI1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Pde4cQ3UEI1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Pde4cQ3UEI1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Pde4cQ3UEI1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Pde4cQ3UEI1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Pde4cQ3UEI1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Pde4cQ3UEI1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Pde4cQ3UEI1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Pde4cQ3UEI1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Pde4cQ3UEI1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Pde4cQ3UEI1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Pde4cQ3UEI1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Pde4cQ3UEI1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Pde4cQ3UEI1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Pde4cQ3UEI1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Pde4cQ3UEI1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Pde4cQ3UEI1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Pde4cQ3UEI1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Pde4cQ3UEI1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Pde4cQ3UEI1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Pde4cQ3UEI1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Pde4cQ3UEI1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Pde4cQ3UEI1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Pde4cQ3UEI1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Pde4cQ3UEI1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Pde4cQ3UEI1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Pde4cQ3UEI1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Pde4cQ3UEI1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Pde4cQ3UEI1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Pde4cQ3UEI1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Pde4cQ3UEI1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Pde4cQ3UEI1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Pde4cQ3UEI1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Pde4cQ3UEI1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Pde4cQ3UEI1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Pde4cQ3UEI1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Pde4cQ3UEI1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Pde4cQ3UEI1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Pde4cQ3UEI1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Pde4cQ3UEI1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Pde4cQ3UEI1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Pde4cQ3UEI1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Pde4cQ3UEI1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Pde4cQ3UEI1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Pde4cQ3UEI1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Pde4cQ3UEI1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Pde4cQ3UEI1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Pde4cQ3UEI1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Pde4cQ3UEI1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Pde4cQ3UEI1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Pde4cQ3UEI1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Pde4cQ3UEI1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Pde4cQ3UEI1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Pde4cQ3UEI1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Pde4cQ3UEI1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Pde4cQ3UEI1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Pde4cQ3UEI1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Pde4cQ3UEI1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Pde4cQ3UEI1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Pde4cQ3UEI1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Pde4cQ3UEI1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Pde4cQ3UEI1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Pde4cQ3UEI1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Pde4cQ3UEI1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Pde4cQ3UEI1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Pde4cQ3UEI1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Pde4cQ3UEI1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Pde4cQ3UEI1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Pde4cQ3UEI1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms