Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TraddQ3U0V2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TraddQ3U0V2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms