Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdkl4Q3TZA2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkl4Q3TZA2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms