Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shcbp1lQ3TTP0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shcbp1lQ3TTP0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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